Όλο το νησί ανήκει στο δίκτυο NATURA 2000 και προστατεύεται από την ελληνική και ευρωπαϊκή νομοθεσία. Tο πρόγραμμα JUNICOAST “Δράσεις για την προστασία των παράκτιων αμμοθινών με είδη Juniperus στην Κρήτη και στο Νότιο Αιγαίο (Ελλάδα)” (LIFE07NAT/GR/000296) υλοποιήθηκε από το πρόγραμμα LIFE+ 2007-2013 για το περιβάλλον. Αντικείμενο του προγράμματος είναι η προστασία του οικοτόπου των παράκτιων αμμοθινών με είδη Juniperus. Σύμφωνα με την Κοινοτική οδηγία των οικοτόπων 92/43 (Habitats Directive), οι παράκτιες αμμοθίνες με είδη Juniperus αποτελούν οικότοπο προτεραιότητας (κωδικός 2250*). Ο οικότοπος προτεραιότητας των παράκτιων αμοθινών με είδη κέδρων απαντάται σε 3 περιοχές της νήσου Γαύδου, στο Σαρακήνικο, στην παραλία του Άγιου Ιωάννη και στο Λαυρακά.
